Калужская специальная школа – старейшее учебное заведение для детей с отклонениями в развитии – начинает отсчет своей истории в 1918 году, когда декретом В.И. Ленина были открыты специальные классы на базе психиатрической больницы, где воспитанников учили чтению, письму, счету и ремеслам, прививали навыки самообслуживания. Позднее эта маленькая школа превратилась в образовательное учреждение – специальную школу №4. Из воспоминаний учителей-ветеранов известно, что школа не работала только в период оккупации, но уже в январе 1942 года, сразу после освобождения Калуги от немецко-фашистских захватчиков (30 декабря 1941 года) ученики 4-ой специальной школы сели за парты. Трудности военных лет легли на плечи руководителя и учителей школы: заготовка дров для печного отопления, борьба с тифом (еженедельные сводки об этом хранятся в городских архивах). Из архивных документов юные краеведы нашей школы узнали о том, что многие учителя в эти тяжелые для всей страны годы ушли на фронт, чтобы с оружием в руках защищать свою Родину.
В школе бережно хранят память о тех, кто не вернулся с фронта, отдав свои жизни за победу, за нашу мирную жизнь. В музее архива сегодняшним школьникам рассказали, что в те трагические годы не хватало учителей (специалистов с высшим специальным образованием), но в школу пришли фронтовики: Богданов Александр Андреевич – бывший летчик стал учителем рисования и черчения; именно в те годы учителем труда работал Чистяков Валентин Михайлович, прошедший через всю блокаду Ленинграда; медицинская сестра Груздева Тамара Сергеевна, с фронта в школу пришел Зуев Иван Алексеевич. Ученики и педагоги школы знают, помнят и гордятся этими самоотверженными людьми. Не забыты и труженики тыла, работавшие в нашей школе в военное и послевоенное время: Глотова П.П., Алдошин В.П., Мережаная Л.А., Дрынева А.И., Рыжов В.П., Малькова В.М. Уже в то время коллектив школы отличали стремление проводить всю работу с учениками на самом высоком уровне, постоянный поиск новых форм работы с детьми и подростками.
До 1972 года школа работала в двухэтажном здании на ул. Ленина, 77 (позднее располагалась «Детская школа искусств»), имела большой земельный участок (сейчас на этом месте расположен Дом художника и построены многоквартирные дома).
В 1972 году вспомогательная школа № 40 переехала в здание Александровского училища (ул. Луначарского, 16), являющееся объектом культурного наследия.
В 1997 году школа получает название Муниципальное специальное (коррекционное) образовательное учреждение VIII вида «Школа № 40 г. Калуги», а приказом министерства образования, культуры и спорта Калужской области от 21.12.2005 г. №2013 переименовано в Государственное специальное (коррекционное) образовательное учреждение для обучающихся (воспитанников) с отклонениями в развитии «Специальная (коррекционная) общеобразовательная школа № 40 г. Калуги VIII вида».
С 2007 года школа имеет название: Государственное специальное (коррекционное) образовательное учреждение для обучающихся (воспитанников) с ограниченными возможностями здоровья «Специальная (коррекционная) общеобразовательная школа № 40 г. Калуги VIII вида».
В 2011 году приказом министерства образования и науки Калужской области переименовывается в Государственное казенное специальное (коррекционное) образовательное учреждение Калужской области для обучающихся, воспитанников с ограниченными возможностями здоровья «Калужская специальная (коррекционная) общеобразовательная школа № 40 VIII вида».
В соответствии с приказом министерства образования и науки от 10.09.2012 года №1629 школа получает название: Государственное казенное специальное (коррекционное) образовательное учреждение Калужской области для обучающихся, воспитанников с ограниченными возможностями здоровья «Калужская специальная (коррекционная) общеобразовательная школа VIII вида «Гармония». Сокращенно: ГКС(К)ОУ «Калужская школа VIII вида «Гармония».
Название «Гармония» во многом символично и определяет пространство школы как пространство гармонии отношений детей, педагогов и родителей. Сегодня школа «Гармония» - это единственное в городе образовательное учреждение, реализующее адаптирванную основную общеобразовательную программу образования обучающихся с интеллектуальными нарушениями, с выстроенной двухступенчатой системой обучения, которая позволяет ребенку адаптироваться в современном мире, духовно обогащаться, успешно интегрироваться в современное общество (сделав выбор будущей профессии).
В 2015 году в соответствии с ФЗ №273-ФЗ "Об образовании в РФ" изменяется наименование организации: Государственное казенное общеобразовательное учреждение Калужской области "Калужская школа для обучающихся с ограниченными возможностями здоровья "Гармония", сокращенно: ГКОУКО "Калужская школа "Гармония" (приказ министерства образования и науки Калужской области №2605 от 30.11.2015г.).
В 2016 году школа переехала в новое здание по адресу: г. Калуга, ул. Салтыкова-Щедрина 66а, где и располагается сейчас.